微生物同化过程驱动土壤有机碳形成和积累的关键作用已成为国际上的新共识，微生物碳泵功能的发挥受多种内在和外在因素的影响，其中，病毒感染作为微生物代谢和死亡的重要驱动因素，可能是调控微生物碳泵的关键途径。然而，土壤病毒影响微生物群落群落演替和碳循环的作用机制依然缺乏研究。本研究利用微宇宙培养试验探究了土壤病毒对微生物群落演替和土壤有机碳周转的影响，结果表明土壤病毒显著地改变了微生物群落结构和功能基因丰度，是微生物群落多样性形成的重要因素，大幅降低了农田土壤中假单胞菌、不动杆菌、黄杆菌和芽孢杆菌的相对丰度，增加了丛毛单胞菌的相对丰度，在培养的中后期，病毒感染提高了微生物碳、氮、磷循环的功能基因丰度。病毒裂解显著提升了可溶性碳的含量，促进了有机碳的周转，并显著减少了CO₂和N₂O的排放，增加了微生物残体的积累，表明病毒感染提升了微生物碳利用效率，加速了微生物群落更替。以上结果表明，土壤病毒可显著影响微生物代谢网络，并通过裂解作用调控微生物群落结构和演替，病毒介导的微生物死亡对于物质循环和养分条件具有重要影响，保持微生物活性，有助于促进土壤有机碳的周转和稳定过程。因此，揭示土壤病毒的生态功能是加深理解土壤碳固存微生物学机理的新思路，可为土壤有机质提升提供科学依据。

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