全球变暖及人类活动造成的湖泊升温和富营养化，加剧了湖泊底部厌氧环境的形成，进而影响湖泊生态系统碳循环过程。然而，有氧和厌氧条件下湖泊沉积物中有机碳矿化过程的差异目前尚不清楚。本研究采集了青藏高原6个不同盐度湖泊作为研究对象，分别在有氧和厌氧条件下进行沉积物的微宇宙实验培养，探究有氧/厌氧条件下湖泊沉积物有机碳矿化过程。结果显示:厌氧条件下的湖泊沉积物有机碳矿化速率（87.5-298.66 μmol/g/h）显著高于（P < 0.05）有氧条件下的矿化速率（5.81-23.45 μmol/g/h），暗示全球变化导致的湖泊底层厌氧会加速湖泊沉积物有机碳的矿化，进而导致更多碳排放。有机碳矿化速率与盐度、SO₄^2-、Na⁺、Cl^-等环境变量呈显著负相关关系；与微生物多样性（Richness和Shannon指数）呈显著正相关关系。值得注意的是，在咸盐湖泊中，微生物多样性在有氧条件下均显著高于厌氧条件。微生物群落组成在有氧和厌氧条件下存在差异，其中，Deinococci，Halanaerobiia和Gammaproteobacteria对群落差异的贡献最大。有氧/厌氧条件下微生物群落多样性和组成差异是导致湖泊沉积物有机碳矿化速率差异的重要原因。上述研究结果有助于加深理解全球变化背景下的湖泊碳循环过程及其对环境变化的反馈。