水生生态系统中微生物昼夜分布模式和影响因素已得到广泛研究，由于土壤生态系统的复杂性及其与植被的紧密关系，其微生物群落的昼夜节律尚未被证实。为此，我们利用宏转录组测序技术，研究了2020年8月中旬青藏高原高寒草甸对照(CK)和植被去除(H2019)处理下土壤微生物群落的昼夜变化，并揭示微生物种群生长、分裂和休眠等生活史性状变化对温湿度和植物状况的响应规律。研究表明：(1) CK和H2019的微生物群落多样性、结构和绝对丰度均呈显著昼夜周期变化，土壤含水量与微生物群落绝对丰度呈显著正相关，而土壤温度仅对H2019微生物多样性有显著影响；同时，H2019微生物跨域生态网络相互作用强度和紧密性高于CK。(2) 土壤微生物群落整体mRNA、生活史标志基因表达量呈明显昼夜变化，在降雨后的8/14 8:00-12:00达到峰值。H2019的DNA损伤修复、信号通路和ATP转运等基因与温度呈显著正相关，而转录因子、分泌物、生物膜形成、群体感应和产芽孢等基因与温度负相关，表明不同温度下微生物的环境适应策略。(3) CK处理下碳氮磷硫循环功能基因表达量在降雨后达到峰值，而H2019无明显变化，这可能与植被营养输入密切相关。本研究有助于深化理解土壤微生物响应环境变化的生理和分子机制，并为优化生物地球化学循环模型提供数据支持。

微生物，植被，昼夜节律，生活史性状，生态系统功能