CTCF reshapes 3D genome to control CD8+ T cell activation
编号:19
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更新:2025-03-25 13:56:13
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口头报告
摘要
免疫系统要应对各种外界病原体的入侵,需要快速地分化成不同的细胞类型。而三维染色质结构的变化如何影响细胞状态转变,是理解基因调控机制的关键所在。申请人的方向是基于表观遗传学和三维基因组学的基因表达调控研究,以及其在免疫系统细胞状态转变的应用。申请人通过ATAC-seq, Chip-seq, CUT&RUN, RNA-seq以及HiC等高通量多组学数据分析手段,系统的研究了CD8+T细胞在不同外界刺激下细胞状态转变的转录调控过程,并发现了三维染色质相互作用调节基因表达的新的机制。计算方面开发了分析三维基因组数据的HiCHub算法,该算法能够全面的分析染色质集体相互作用的模式,并且能定量分析不同细胞类型之间的差异以及和基因表达的关系。
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