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Interrogation of the dynamic RNA splicing heterogeneity and the splicing regulation with machine learning
编号：64
访问权限：仅限参会人
更新：2025-03-25 14:37:17
浏览：27次
口头报告
报告开始：2025年03月30日 09:00（Asia/Shanghai）
报告时间：30min
所在会场：[S7] 前沿论坛 （基因组大数据与AI） [s7] 前沿论坛（基因组大数据与AI）
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摘要
RNA可变剪接是高等真核生物中重要的转录后调控机制，体现了基因复杂功能的多样性与可塑性。当前主流的细胞异质性分析以单细胞基因表达谱为基础，几乎完全忽略了RNA可变剪接在塑造生理状态、执行生物学功能及驱动疾病发展中的关键作用。针对这一空白，我们开发了SCASL工具，重点解决单细胞RNA剪接数据的低覆盖度与高稀疏性问题，使用谱聚类机器学习方法绘制单细胞RNA剪接异质性图谱。基于剪接谱的细胞类群定义具有更明确的生物学与生理学意义，并更加精细地刻画了细胞发育、分化的动态过程。进一步，为探索剪接异质性的内在驱动力，我们开发了基于梯度增强集成学习的DSRIL工具，通过可解释性机器学习鉴定细胞特异的可变剪接调控因子，挖掘剪接异质性动态演化的驱动机制。研究成果为理解复杂生理病理过程提供了新的视角与工具。
关键词
暂无
报告人
杨雪瑞
教授 清华大学全部评论
重要日期
-
会议日期
03月28日
2025
至03月30日
2025
-
04月15日 2025
注册截止日期
主办单位
中国生物信息学学会基因组信息学专业委员会
承办单位
中国农业科学院农业基因组研究所
大鹏湾实验室
大鹏湾实验室
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