异手性氨基酸与肽结构功能的计算模拟研究
编号:117
访问权限:仅限参会人
更新:2026-09-28 14:53:22
浏览:1次
青年邀请报告
摘要
在生命起源研究中,现代地球生命的结构蛋白几乎全部由同手性L型氨基酸构成,然而前生命地球及地外天体中的化学初始条件可能使L型与D型氨基酸处于外消旋态。小行星可作为星际旅行载体向早期地球输送氨基酸,碳质小行星龙宫和贝努的采样分析已检出数十种氨基酸,结合默奇森、默里等碳质球粒陨石的研究显示,L-氨基酸可能存在微量的对映体过剩。与此同时,热液喷口和大气放电等假说也容易产生外消旋态的氨基酸。因此,同手性是否为原始生命所必需,成为一个关键的科学问题。研究采用了计算天体生物学的方法,选取前生命化学体系中最常见的10种原始氨基酸及其代表性短肽(分别具有特征性的短β折叠、长α螺旋、长β折叠加短α螺旋以及无规则卷曲)作为模型。在分子力场中,我们将特定类群的L-残基整体替换为D-构型,并比较D-突变前后的折叠能、二级结构占比以及相互作用(包括氢键、疏水作用和二硫键)。模型结果显示,D-突变发生在N端、中段或C端等不同空间位置,对最小折叠能具有显著影响,而氨基酸的化学属性(酸性、羟基、脂肪族)则无明显影响。长α螺旋、长β折叠与无规则卷曲对D-突变较为不敏感,而短β折叠最易失稳,其中脯氨酸的D-突变具有结构性破坏力。部分氨基酸的D-构型(如天冬氨酸、谷氨酸、丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸、异亮氨酸)可与L-残基协同维持二级结构,个别组合(如亮氨酸与丝氨酸)的D-突变甚至能降低折叠能,从而有利于结构稳定。此外,对129个D-突变残基的统计分析显示,其稳定、失稳与中性比例约为1:1:1。研究结果表明,原始生命有可能在同手性机制确立之前就已起源,L/D混合氨基酸肽可作为代谢与结构元件。地外样品分析可进一步检证肽类是否存在,其手性构成及二级结构是否以α螺旋、长β折叠或无规卷曲为主,从而为同手性可能并非生命起源的必要前提提供实测检验。该工作将计算模拟与行星探测相衔接,对理解前生命化学与地外宜居性研究具有重要参考意义。
发表评论